Bathar

Tha sgrùdaidhean immunoprecipitation chromatin air feadh genome (ChIP) air sealladh mòr a thoirt a-steach don sgìre genomic de phròtainean co-cheangailte ri cromatin agus atharrachaidhean histone.Tha an ìre mhòr de dhàta a thig bho na mion-sgrùdaidhean sin, ge-tà, a’ feumachdainn dòighean-obrach a leigeas le dearbhadh agus mion-sgrùdadh luath air buntainneas bith-eòlasach.A bharrachd air an sin, tha targaidean pròtain is atharrachaidh ann fhathast a tha duilich an lorg le bhith a’ cleachdadh dhòighean àbhaisteach ChIP.Gus dèiligeadh ris na cùisean sin, leasaich sinn modh-obrach immunoprecipitation chromatin sa bhad ris an can sinn ZipChip.Bidh ZipChip a’ lughdachadh na h-ùine gu mòr agus a’ meudachadh cugallachd a’ ceadachadh sgrìonadh luath air ioma loci.An seo tha sinn a ’toirt cunntas air mar a tha ZipChIP a’ comasachadh atharrachaidhean histone a lorg (mono- agus trimethylation H3K4) agus dà demethylases histone giosta, Jhd2 agus Rph1, a bha roimhe seo duilich a lorg a ’cleachdadh dhòighean àbhaisteach.A bharrachd air an sin, tha sinn a’ nochdadh sùbailteachd ZipChIP le bhith a’ dèanamh anailis air beairteas an histone deacet ylase Sir2 aig heterochromatin ann am beirm agus beairteas an ath-mhodail chromatin, PICKLE, aig euchromatin ann an Arabidopsis thaliana.