Bathar

Chaidh topology membran an t-seanail colicin E1 a sgrùdadh le gluasad lùth ath-shuidheachadh fluorescence (FRET).Bha an FRET a’ toirt a-steach amino-aigéad fluaraiseach (coumarin) a chaidh a chòdachadh gu ginteil mar an tabhartaiche agus fuigheall cysteine ​​le bileag roghnach ceangailte ri DABMI (4- (dimethylamino) phenylazophenyl-4’-maleimide) mar an neach-gabhail FRET.Chaidh am fuigheall coumarin fluorescent a thoirt a-steach don phròtain tro phaidhir synthetase tRNA / aminoacyl-tRNA orthogonal a leig le toirt a-steach roghnach a-steach do làrach sam bith taobh a-staigh raon seanail colicin.Bha a h-uile caochladair a’ cumail mùthadh stad (TAG) airson toirt a-steach coumarin agus mùthadh cysteine ​​(TGT) airson ceangal DABMI.Chaidh sia astaran eadar-roinneil taobh a-staigh helices 1-6 a dhearbhadh le bhith a’ cleachdadh mion-sgrùdadh FRET airson gach cuid na stàitean soluble agus ceangailte ri membran.Sheall dàta FRET atharrachaidhean mòra anns na h-astaran eadar-heliach am measg helices 3-6 air ceangal membran a’ toirt sealladh ùr air structar ceangailte ri membran ann an raon an t-seanail.San fharsaingeachd, lughdaich èifeachdas eadar-helical coumarin-DABMI FRET air ceangal membran, a’ togail air a’ mhodail sgàile airson an t-sianail colicin.Chaidh modal mì-chinnteach a leasachadh airson staid dhùinte àrainn an t-seanail stèidhichte air dàta FRET gnàthach agus a chaidh fhoillseachadh roimhe.Tha am modail a’ moladh rèiteachadh cruinn de helices 1-7 ann an taobh deiseal bhon taobh extracellular agus an ceangal eadar-aghaidh membran de helices 1, 6, 7, agus 10 timcheall air a’ phìob fuilt transmembrane sa mheadhan air a chruthachadh le helices 8 agus 9.